Η ακαδημαϊκή οργάνωση του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας μετά την δημοσίευση του νόμου 4589 (ΦΕΚ 13 τ.Α΄/29.01.2019) έχει ως εξής:
Σχολή Ανθρωπιστικών και Κοινωνικών Επιστημών (Βόλος)
- Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης
- Παιδαγωγικό Τμήμα Προσχολικής Εκπαίδευσης
- Παιδαγωγικό Τμήμα Ειδικής Αγωγής
- Τμήμα Ιστορίας, Αρχαιολογίας και Κοινωνικής Ανθρωπολογίας
- Τμήμα Πολιτισμού και Δημιουργικών Μέσων και Βιομηχανιών (νέο)
- Τμήμα Γλωσσικών και Διαπολιτισμικών Σπουδών (νέο)
- Τμήμα Ψυχολογίας (νέο)
- Τμήμα Αγωγής και Φροντίδας στην Πρώιμη Παιδική Ηλικία (νέο)
Σχολή Επιστημών Υγείας
- Τμήμα Ιατρικής
- Τμήμα Κτηνιατρικής
- Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας
- Τμήμα Νοσηλευτικής (νέο)
- Τμήμα Δημόσιας και Ενιαίας Υγείας (νέο)
- Τμήμα Φυσικοθεραπείας (νέο)
- Τμήμα Λογοθεραπείας (νέο)
Σχολή Γεωπονικών Επιστημών (Βόλος)
- Τμήμα Γεωπονίας, Ιχθυολογίας και Υδάτινου Περιβάλλοντος
- Τμήμα Γεωπονίας, Φυτικής Παραγωγής και Αγροτικού Περιβάλλοντος
- Τμήμα Γεωπονίας – Αγροτεχνολογίας (νέο)
- Τμήμα Επιστήμης Ζωικής Παραγωγής (νέο)
- Τμήμα Επιστήμης Τροφίμων και Διατροφής (νέο)
Πολυτεχνική Σχολή (Βόλος)
- Τμήμα Μηχανολόγων Μηχανικών
- Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Η/Υ
- Τμήμα Μηχανικών Χωροταξίας, Πολεοδομίας και Περιφερειακής Ανάπτυξης
- Τμήμα Αρχιτεκτόνων Μηχανικών
- Τμήμα Πολιτικών Μηχανικών
Σχολή Θετικών Επιστημών (Λαμία)
- Τμήμα Πληροφορικής και Εφαρμογές στη Βιοϊατρική
- Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών
- Τμήμα Φυσικής (νέο)
- Τμήμα Μαθηματικών (νέο)
Σχολή Τεχνολογίας (Λάρισα)
- Τμήμα Συστημάτων Ενέργειας (νέο)
- Τμήμα Περιβάλλοντος (νέο)
- Τμήμα Ψηφιακών Συστημάτων (νέο)
- Τμήμα Δασολογίας, Επιστημών Ξύλου και Σχεδιασμού (νέο)
Σχολή Οικονομικών και Διοικητικών Επιστημών (Λάρισα)
- Τμήμα Οικονομικών Επιστημών
- Τμήμα Λογιστικής και Χρηματοοικονομικής (νέο)
- Τμήμα Διοίκησης Επιχειρήσεων (νέο)
Σχολή Επιστημών Φυσικής Αγωγής, Αθλητισμού και Διαιτολογίας
Τα νέα τμήματα έχουν θεσμοθετηθεί σύμφωνα με το άρθρο 22 του νόμου 4589 (ΦΕΚ 13 τ.Α΄/29.01.2019).
